Склейка микроскопических изображений – функция, подобная сборке панорамы из отдельных кадров в обработке фотографий. Если у Вас есть набор изображений поверхности, снятых с перекрытием не менее 10 % от площади кадра, то функция Сшивка изображений позволит Вам собрать их в общую картину поверхности.

Перед началом работы сшивателя, обработайте все изображения, которые будут использоваться, при помощи стандартных функций усреднения по строкам и выравнивания поверхности. Затем выберите активным одно из изображений серии и вызовите функцию Склейка изображений из меню Математика → Корреляция или при помощи кнопки

.

Появится диалоговое окно, в котором слева расположен список всех открытых в программе окон, справа –- окно быстрого просмотра. Выберите в списке изображения, которые Вы хотите сшить и нажмите кнопку Выбрать.

После этого начнется сшивка изображений. Процесс может занять заметное время, для большого количества кадров –- несколько минут. В результате работы функции будет построено склеенное изображение и в виде таблицы выведены параметры сшивки –- смещения каждого из изображений на конечном полотне относительно левого нижнего угла по направлениям X и Y, вес совпадения областей поиска перекрытия в данной паре.

Помимо описанной выше таблицы и готового изображения, после работы сшивателя появляется окно параметров. По умолчанию в нем установлены параметры, которые в большинстве случаев позволяют получить адекватное качество сшивки, если же Вас не устраивает полученное изображение, попробуйте перенастроить параметры.

Пора разобраться, как работает функция склейки изображений. Основная идея алгоритма состоит в поиске корреляции между областями, находящимися на краях кадров и определении локальных максимумов корреляции. По самым сильным максимумам изображения сшиваются. В ходе работы алгоритма используются следующие параметры (см. схему):

• Margin – иногда края АСМ изображений искажены дрейфом, в этом случае учет этих данных при расчете корреляции нежелателен. Параметр Margin позволяет при расчете корреляции отступить от краев изображения на его величину. Задается в долях от длины стороны изображения, по умолчанию значение этого параметра равно нулю.
• Along – длина прямоугольных областей, используемых для расчета корреляций. При сшивке «справа» и «слева»- это длина прямоугольника вдоль оси Y, при сшивке «сверху» и «снизу» - по оси X. Задается в долях от длины стороны изображения, по умолчанию значение этого параметра равно 0,5.
• Across – ширина прямоугольных областей, используемых для расчета корреляций. При сшивке «справа» и «слева» – это ширина прямоугольника вдоль оси X, при сшивке «сверху» и «снизу» – по оси Y. Задается в долях от длины стороны изображения, по умолчанию значение этого параметра равно 0,2.
• Local maximum threshold level – в некоторых случаях сшивание изображений проходит более эффективно если при расчетах учитывать не только сами локальные максимумы корреляции, но и точки с близким к максимуму значениями корреляции. Данный параметр задает величину порога, по которому отбираются такие точки. Задается в долях от величины максимума, по умолчанию значение этого параметра равно нулю.
• Precision, nm – в ходе расчетов точки, соответствующие максимумам корреляции двух соседних изображений, определяются независимо, и их положения должны совпасть с некоторой наперед заданной точностью. Величина допустимого смещения максимумов друг относительно друга определяется параметром Precision, nm. Задается в нанометрах, по умолчанию равно нулю.