Функция Анализ шероховатости из меню Математика вычисляет набор параметров, характеризующих шероховатость поверхности на выделенном участке, или на всем изображении.

При вызове функции появляется диалоговое окно, в котором могут быть настроены некоторые опции для дальнейшего анализа.

В простейшем случае, шероховатость (а именно R_a, средняя шероховатость) - это среднее арифметическое отклонение профиля сечения от прямой его общего наклона. Для того, чтобы определить среднюю шероховатость поверхности строят несколько ее сечений. Диалоговое окно Параметры дает возможность выбрать количество таких сечений, расстояние между соседними сечениями, длину сечений и угол их наклона к горизонтали.

Угол наклона можно задавать вручную. Если же поверхность представляет собой слоистую структуру, то лучше использовать автоматическое определение угла. В этом случае сечения будут проведены в направлении, перпендикулярном направлению с наименьшей шероховатостью. Дополнительно будет выведено окно с гистограммой, по которой определялось это направление. Это зависимость среднего количества пересечений сечения со своей средней линей от угла. Минимум этой зависимости соответствует направлению ступеней. Параметр Точность - это шаг по углу, который используется при построении графика.

Важно правильно провести сечения по интересующей части изображения. Если Вы хотите определить, например, шероховатость бактерии, то сечения должны попадать только на горизонтальную часть бактерии, где вклад в высоту дает именно шероховатость, а не общий рельеф клетки (на рисунке слева - неправильный вариант проведения сечений, справа - правильный). Кроме того, всегда можно вырезать интересующий участок изображения при помощи функции Обрезать и работать с полученным изображением.