Если на изображении выделена прямоугольная область, то при помощи команды Обрезать из меню Математика или кнопки

изображение будет обрезано по границе этой области.

Если на изображении выделена область произвольной формы, то с помощью той же кнопки изображение будет обрезано по границам прямоугольника, описанного вокруг выделенной области.